درگیری‌های اخیر میان کابل و اسلام‌آباد در امتداد خط فرضی دیورند، زندگی مهاجرین افغان در پاکستان را نیز تحت تاثیر قرار داده است.
برخی از مهاجران افغان که در پاکستان به سر می‌برند به خبرگزاری آفاق گفتند که در آن کشور با دشواری و نا هنجاری های زیادی رو به رو استند آنان از حکومت پاکستان و مقام‌های امارت اسلامی می‌خواهند که مساله مهاجران افغان در پاکستان را از طریق گفت‌وگو حل کنند.
مجاهدخان شینواری، مهاجر افغان در پاکستان به خبرگزاری آفاق گفت: «پاکستان و افغانستان هر دو کشورهای اسلامی استند، هر دو کشور باید با کنار گذاشتن جنگ مساله که میان شان است را حل کنند و مهاجران افغان که در جنگ نقشی ندارند، نباید آسیب ببینند.»
عتیق‌الله منصور، مهاجر دیگر افغان در پاکستان نیز به خبرگزاری آفاق گفت: «مهاجران مردمانی صلح‌دوست‌اند و همواره برای پاکستان و افغانستان نیک بوده‌اند البته در روزهای اخیر شدت برخوردها و فشارها علیه مهاجران افغان در پاکستان افزایش یافته است.»
هم‌زمان با این، برخی از فعالان عرصه حقوق مهاجران می‌گویند که مساله مهاجران موضوع حقوق بشری بوده که نباید با مسایل سیاسی ربط داده شود آنان می‌گویند که پاکستان باید با درنظر گرفتن کنوانسیون‌های بین‌المللی و حفظ کرامت انسانی مهاجران با آنان برخورد کند.
محمدخان طالبی محمدزی، فعال عرصه حقوق مهاجران دراین مورد به خبرگزاری آفاق گفت: «دولت پاکستان، به‌عنوان یک کشور مسلمان، باید به تعهدات انسانی و اسلامی خود در قبال مهاجران افغان پای‌بند بماند، اخراج‌های شتاب‌زده و غیرانسانی، بدون درنظر گرفتن ابعاد انسانی و قانونی آن، اقدامی نادرست است.»
این در حالیست که پیش از این خواجه آصف، وزیر دفاع پاکستان پس از درگیری‌های اخیر با ادعای این‌که “اوضاع افغانستان رو به وخامت است” گفته که پاکستان ناگزیر است مهاجران افغان را که حدود ۵۰ سال در خاک این کشور زندگی کرده‌اند، به افغانستان بازگرداند.